Через 200 лет после событий на планете-тюрьме учёные клонируют Элен Рипли, чтобы получить Королеву Чужих. Однако ДНК Элен смешивается с инопланетной ДНК и в итоге получается нечто, откладывающее яйца, с характеристиками человека и пришельца. Это нечто вскоре вырывается из лаборатории и захватывает весь научно-исследовательский корабль «Аурига». Ситуация выходит из под контроля.