В одно мгновение жизнь Хаято рушится, когда гигантский робот Голем, круша Токио, убивает его родителей. Все уверены, что разрушитель был послан таинственным капитаном с Корабля-Призрака, который бороздит океан и уничтожает все судна, попадающиеся ему на пути. Все, но не Хаято. Герой уверен, что здесь что-то не так. Поэтому он отправляется в опасное путешествие, чтобы раскрыть тайну Корабля и остановить захватчика.